[Lokky]

"У слов медитация и медицина один и тот же латинский корень - "медикус", что означает "исцелять", а также "измерять".

У этого слова другое происхождение.

МЕДИТАЦИЯ (от лат. meditatio — размышление), умственное действие, цель которого — приведение психики человека в состояние углубленности и сосредоточенности;

[WhiteAUrum]

Там сказано о корне. А если уж быть совсем точными, то

"Слово медитация произошло от санскритского слова "медха", которое можно перевести, как "делать мудро". Также происхождение этого слова можно вывести от латинского "медитари", что означает "размышлять, задумываться".

Источник тот же.
Не заметить сходства между "медицина" и "медитация" все-таки сложно.